Vyšetření mikrosatelitové instability

Molekulárně genetická laboratoř Vyšetření aneuploidií chromosomů 13, 18, 21, X a Y metodou QF-PCR Vyšetření genu pro cystickou fibrosu (CFTR) Vyšetření trombofilních mutací v genech Identifikace osob, paternitní expertízy Preimplantační genetické vyšetření monogenních chorob Vyšetření nejčastějších mutací v genu pro hemochromatózu (HFE) Vyšetření mikrodelecí chromozomu Y u mužů s poruchou plodnosti Vyšetření GJB2 genu (Connexin 26) Vyšetření mikrosatelitové instability Vyšetření mutací v genech BRCA1 a BRCA2

Kolorektální karcinom je v ČR druhým nejčastějším nádorovým onemocněním jak u mužů, tak u žen. Jeho incidence u nás patří mezi nejvyšší na světě – v roce 1999 to bylo 72,41 onemocnění na 100 tisíc obyvatel. Celoživotní riziko tohoto onemocnění je 2 - 4%, riziko je ovlivňováno hereditárními faktory a faktory životního stylu. 20-30% všech kolorektálních karcinomů je familiárních, 3-5% se vyvíjí v rámci syndromů hereditární nádorové predispozice. Hereditární nonpolyposní kolorektální karcinom (HNPCC) patří k nejčastějším z těchto syndromů. HNPCC je charakterizován časnou manifestací (průměrný věk výskytu je 45 let), mikrosatelitovou instabilitou (MSI) a výskytem dalších neoplasií v postižených rodinách. Příčinou HNPCC jsou germinální mutace mismatch repair (MMR) genů.

Vyšetření MSI z kolorektálního karcinomu lze použít jako screeningovou metodu k vyhledání pacientů se suspektním HNPCC. Dle recentních studií je MSI status samostatným prognostickým faktorem, v budoucnu by snad mohl být jedním z vodítek k výběru vhodné terapie.

Úkolem DNA reparačních (MMR) genů (MHL1, MSH2, PMS1, PMS2, MSH6) jsou opravy chyb replikace DNA při mitose: chybného párování basí, delecí a inzercí. Výsledkem kombinace funkčních (hypermethylace promotorů) nebo strukturních (delece, inserce) mutací MMR genů a zevních vlivů je kumulace somatických mutací onkogenů a tumor supresorových genů a malignizace buňky.

Mikrosatelity (MS) jsou krátké nekodující mono - trinukleidové repetitivní sekvence roztroušené v různých nekodujících místech genomu. Při mitotické replikaci v nich dochází často k mutacím, takže při omezené funkci MMR genů lze zjistit rozdíly mezi počtem repeatů na určitých MS lokusech v různých tkáních stejného jedince: např v tkání zdravé – referenční a tkáni tumoru. Tento nález se označuje jako instabilita mikrosatelitů (MSI). MSI tedy slouží jako obecný marker efektivity MMR genů a genomické stability zkoumané tkáně. MSI je jedním z tkáňových nádorových markerů.

MSI vykazuje asi 15% všech kolorektálních karcinomů, karcinomů asociovaných s HNPCC až 90%. U pacientů s prokázanou MSI v tumoru je indikována analýza germinálních mutací MMR genů.

Indikačními kritérii k vyšetření MSI jsou Bethesdanská kritéria definovaná v roce 1996 a revidovaná v roce 2002.
Metodiku vyšetření nejčastějších mikrosatelitové instability má laboratoř molekulární genetiky GENNET akreditováno dle normy 15189:2007.